Der Gemeinderat ist die Exekutive und damit Führungs- und Vollzugsorgan der Gemeinde. Er vertritt die Gemeinde nach aussen. In Zetzwil besteht der Gemeinderat aus 5 Mitgliedern (Gemeindeammann, Vizeammann, drei Gemeinderäte). Die Gemeindebehörde wird für eine vierjährige Amtsdauer nach dem Majorzverfahren gewählt. Die ordentlichen Gemeinderatssitzungen finden jeden 2. Montag statt. Sie sind nicht öffentlich. Die zu behandelnden Akten sind der Gemeindekanzlei rechtzeitig einzureichen.